కొన్ని శిలీంధ్రాలు మానవులలో ముఖ్యంగా రోగనిరోధకశక్తిరోగ నిరోధకశక్తి లోపించిన వారిలో ప్రాణాంతకమైన వ్యాధుల్ని కలుగజేస్తాయి. [[ఏస్పర్జిలస్]], [[కాండిడా]], [[క్రిప్టోకాకస్]], <ref name="Nielsen and Heitman">{{cite journal|author=Nielsen K, Heitman J.|year=2007|title=Sex and virulence of human pathogenic fungi|journal=Adv Genet.|volume=57|pages=143–173|pmid=17352904|doi=10.1016/S0065-2660(06)57004-X}}</ref><ref name="Brakhage">{{cite journal|author=Brakhage AA|year=2005|title=Systemic fungal infections caused by Aspergillus species: epidemiology, infection process and virulence determinants|journal=Curr. Drug Targets|volume=6|pages=875–886|pmid=16375671 | doi = 10.2174/138945005774912717 <!--Retrieved from Yahoo! by DOI bot-->}}</ref> ''[[హిస్టోప్లాస్మా]]'', <ref name="Kauffman">{{cite journal|author=Kauffman CA.|year=2007|title=Histoplasmosis: a clinical and laboratory update|journal=Clin Microbiol Rev.|volume=20|pages=115–132|pmid=17223625|doi=10.1128/CMR.00027-06}}</ref> and ''[[న్యూమోసిస్టిస్]]'' మొదలైనవి.<ref name="Cushion">{{cite journal|author=Cushion MT, Smulian AG, Slaven BE, Sesterhenn T, Arnold J, Staben C, Porollo A, Adamczak R, Meller J.|year=2007|title=Transcriptome of Pneumocystis carinii during Fulminate Infection: Carbohydrate Metabolism and the Concept of a Compatible Parasite|journal=PLoS ONE|volume=2|pages=e423|pmid=17487271 | doi = 10.1371/journal.pone.0000423 <!--Retrieved from Yahoo! by DOI bot-->}}</ref> కొన్ని వ్యాధికారక శిలీంధ్రాలు [[తామర]] వంటి చర్మ వ్యాధుల్ని కలుగజేస్తాయి.
